Fakultas Tarbiyah Kudus yang semula menginduk pada IAIN Sunan Kalijaga Yogyakarta, berdasarkan Keputusan Menteri Agama RI No. 32 Tahun 1970 beralih status menginduk ke IAIN Walisongo. Demikian juga Fakultas Agama IKIP NU Salatiga dan Fakultas Ushuluddin Tegal yang semula akan menginduk pada IAIN Sunana Kalijaga akhirnya menginduk ke IAIN Walisongo bersamaan dengan penegrian dua fakultas itu. Hal tersebut berkat jasa Drs. Chozin Mahmud (Anggota PPH. Kabupaten Tegal) dan beberapa anggota panitia setempat dengan bantuan penuh dari Bupati Tegal waktu itu setelah berkonsultasi dengan ketua umum panitia pendiri IAIN Walisongo.
